4 Phó Trưởng ban gồm Thứ trưởng Nguyễn Danh Huy (Phó Trưởng ban Thường trực), cùng các Thứ trưởng Nguyễn Văn Sinh, Bùi Xuân Dũng và Phạm Minh Hà.
Ban chỉ đạo có 14 thành viên gồm vụ trưởng, cục trưởng các vụ, cục quản lý chuyên ngành thuộc Bộ Xây dựng; Giám đốc Ban quản lý dự án đường sắt; Tổng giám đốc Tổng công ty Đường sắt Việt Nam.
Theo quyết định, Trưởng ban có thẩm quyền thay đổi, bổ sung nhân sự Ban Chỉ đạo trong quá trình hoạt động.

Trước mắt, 2 dự án đường sắt quốc gia sẽ được Ban chỉ đạo của Bộ Xây dựng theo sát là dự án đường sắt tốc độ cao trên trục Bắc - Nam và dự án đầu tư xây dựng tuyến đường sắt Lào Cai - Hà Nội - Hải Phòng. Ảnh minh hoạ
Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ chỉ đạo toàn diện quá trình nghiên cứu, triển khai, giải quyết các vấn đề liên quan nhằm bảo đảm tiến độ, chất lượng các dự án đường sắt do Bộ Xây dựng thực hiện. Đồng thời, chỉ đạo Ban Quản lý dự án Đường sắt và các đơn vị liên quan tổ chức triển khai theo chức năng, nhiệm vụ được giao; phối hợp trong tham mưu, đề xuất các giải pháp kỹ thuật và tổ chức thực hiện; kiểm tra, đôn đốc việc thực hiện theo đúng chủ trương đầu tư và quyết định phê duyệt.
Bộ Xây dựng cũng thành lập bốn tổ giúp việc cho Ban chỉ đạo. Cụ thể, Tổ Thường trực đặt tại Cục Kinh tế - Quản lý đầu tư xây dựng, do Thứ trưởng Nguyễn Danh Huy làm tổ trưởng. Tổ Thường trực chịu trách nhiệm tham mưu tổ chức hoạt động chung của Ban Chỉ đạo, xây dựng kế hoạch, chuẩn bị nội dung các cuộc họp và tổng hợp báo cáo.
Tổ Chuyên gia đặt tại Cục Đường sắt Việt Nam, do Thứ trưởng Phạm Minh Hà làm tổ trưởng, gồm các nhóm chuyên ngành như vận tải, kết cấu hạ tầng, phương tiện, thông tin - tín hiệu, điều khiển và điện sức kéo. Tổ có nhiệm vụ tư vấn kỹ thuật, công nghệ, tiêu chuẩn, quy chuẩn cho Ban Chỉ đạo.
Tổ Phát triển nguồn nhân lực đặt tại Vụ Tổ chức cán bộ, do Thứ trưởng Nguyễn Văn Sinh làm tổ trưởng. Tổ có nhiệm vụ nghiên cứu, đề xuất các giải pháp liên quan tới đào tạo, phát triển nguồn nhân lực thực hiện các dự án; điều phối các hoạt động đào tạo phục vụ phát triển nguồn nhân lực các dự án.
Tổ Thể chế đặt tại Vụ Pháp chế, do Thứ trưởng Bùi Xuân Dũng làm tổ trưởng, phụ trách nghiên cứu, tư vấn về chính sách, pháp luật và thể chế liên quan đến quá trình triển khai dự án.
Trước mắt, 2 dự án đường sắt quốc gia sẽ được Ban chỉ đạo của Bộ Xây dựng theo sát là dự án đường sắt tốc độ cao trên trục Bắc - Nam và dự án đầu tư xây dựng tuyến đường sắt Lào Cai - Hà Nội - Hải Phòng.